Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRTAP24-1Q3LI83 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRTAP24-1Q3LI83 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRTAP24-1Q3LI83 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRTAP24-1Q3LI83 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRTAP24-1Q3LI83 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP24-1Q3LI83 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP24-1Q3LI83 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP24-1Q3LI83 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP24-1Q3LI83 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP24-1Q3LI83 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP24-1Q3LI83 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP24-1Q3LI83 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP24-1Q3LI83 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRTAP24-1Q3LI83 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP24-1Q3LI83 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP24-1Q3LI83 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP24-1Q3LI83 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP24-1Q3LI83 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP24-1Q3LI83 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP24-1Q3LI83 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP24-1Q3LI83 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP24-1Q3LI83 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP24-1Q3LI83 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRTAP24-1Q3LI83 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
KRTAP24-1Q3LI83 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP24-1Q3LI83 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP24-1Q3LI83 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP24-1Q3LI83 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP24-1Q3LI83 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP24-1Q3LI83 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP24-1Q3LI83 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP24-1Q3LI83 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms