Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MRPL23Q16540 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRPL23Q16540 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL23Q16540 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms