Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 GAK-217ENST00000511980 1768 ntTSL 520.23■□□□□ 0.838e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.568e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.428e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.368e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 217.04■□□□□ 0.328e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-213ENST00000510799 763 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.188e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 LCORL-205ENST00000510451 1013 ntTSL 215.24■□□□□ 0.038e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.138e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-221ENST00000515868 3903 ntTSL 214.06□□□□□ -0.168e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.288e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.48e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.048e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.318e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.388e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 AC097512.1-202ENST00000503017 547 ntTSL 25.6□□□□□ -1.518e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 LCORL-208ENST00000637787 9431 ntTSL 54.82□□□□□ -1.648e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 LCORL-204ENST00000510121 486 ntTSL 33.67□□□□□ -1.828e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.988e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.368e-7■■■□□ 17.5
SAFBQ15424 APOL2-206ENST00000476579 583 ntTSL 415.76■□□□□ 0.111e-6■■■□□ 17.3
SAFBQ15424 APOL2-209ENST00000529194 611 ntTSL 311.08□□□□□ -0.641e-6■■■□□ 17.3
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-205ENST00000439794 481 ntTSL 315.94■□□□□ 0.149e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.149e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.459e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-218ENST00000583962 3352 ntTSL 1 (best)12.14□□□□□ -0.479e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-215ENST00000582324 756 ntTSL 311.81□□□□□ -0.529e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-201ENST00000417232 709 ntTSL 36.59□□□□□ -1.359e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.654e-6■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)23.86■■□□□ 1.414e-6■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.094e-6■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.194e-6■■■□□ 16.9
SAFBQ15424 ATAD5-202ENST00000578295 4051 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.624e-6■■■□□ 16.9
SAFBQ15424 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.247e-7■■■□□ 16.8
SAFBQ15424 FAM13A-203ENST00000502459 1993 ntTSL 220.23■□□□□ 0.832e-6■■■□□ 16.8
SAFBQ15424 FAM13A-220ENST00000513837 2590 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.582e-6■■■□□ 16.8
SAFBQ15424 FAM13A-212ENST00000508369 3169 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 16.8
SAFBQ15424 FAM13A-207ENST00000504836 2287 ntTSL 210.95□□□□□ -0.662e-6■■■□□ 16.8
SAFBQ15424 FAM13A-210ENST00000507352 1306 ntTSL 1 (best)10.67□□□□□ -0.72e-6■■■□□ 16.8
SAFBQ15424 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.752e-6■■■□□ 16.8
SAFBQ15424 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 16.8
SAFBQ15424 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.932e-6■■■□□ 16.8
SAFBQ15424 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -12e-6■■■□□ 16.8
SAFBQ15424 EML4-205ENST00000409040 962 ntTSL 1 (best)18.6■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 16.7
SAFBQ15424 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 16.7
SAFBQ15424 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■■□□ 16.7
SAFBQ15424 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■□□ 16.7
SAFBQ15424 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.484e-6■■■□□ 16.4
SAFBQ15424 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-9■■■□□ 16.4
SAFBQ15424 PCSK6-202ENST00000398185 3723 ntTSL 1 (best)10.6□□□□□ -0.714e-6■■■□□ 16.4
SAFBQ15424 PCSK6-207ENST00000558951 543 ntTSL 310.34□□□□□ -0.754e-6■■■□□ 16.4
SAFBQ15424 PCSK6-211ENST00000559605 379 ntTSL 39.85□□□□□ -0.834e-6■■■□□ 16.4
SAFBQ15424 PCSK6-213ENST00000560902 501 ntTSL 48.96□□□□□ -0.984e-6■■■□□ 16.4
SAFBQ15424 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.592e-6■■■□□ 16.1
SAFBQ15424 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.945e-8■■■□□ 16.1
SAFBQ15424 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.495e-8■■■□□ 16.1
SAFBQ15424 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.055e-8■■■□□ 16.1
SAFBQ15424 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.855e-8■■■□□ 16.1
SAFBQ15424 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.975e-8■■■□□ 16.1
SAFBQ15424 FARP1-224ENST00000598389 747 ntTSL 56.41□□□□□ -1.385e-8■■■□□ 16.1
SAFBQ15424 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 415.8■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 16.1
SAFBQ15424 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 16.1
SAFBQ15424 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-7■■■□□ 16
SAFBQ15424 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-7■■■□□ 16
SAFBQ15424 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.091e-7■■■□□ 16
SAFBQ15424 STXBP5-202ENST00000367475 521 ntTSL 55.95□□□□□ -1.461e-7■■■□□ 16
SAFBQ15424 STXBP5-205ENST00000392291 791 ntTSL 54.28□□□□□ -1.721e-7■■■□□ 16
SAFBQ15424 ABHD5-206ENST00000463153 631 ntTSL 210.66□□□□□ -0.71e-7■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.732e-6■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.672e-6■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.197e-7■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 UBE3C-207ENST00000494532 543 ntTSL 216.23■□□□□ 0.197e-7■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 UBE3C-205ENST00000470408 5197 ntTSL 211.49□□□□□ -0.577e-7■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.482e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 ESYT2-202ENST00000275418 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.9■■□□□ 1.262e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.792e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 ESYT2-204ENST00000483958 546 ntTSL 48.72□□□□□ -1.012e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-8■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-8■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-8■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 LINC00470-201ENST00000412816 2031 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.61e-6■■■□□ 15.7
SAFBQ15424 LINC00470-207ENST00000581430 556 ntTSL 57.87□□□□□ -1.151e-6■■■□□ 15.7
SAFBQ15424 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.151e-6■■■□□ 15.7
SAFBQ15424 AC134978.1-201ENST00000579480 788 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.523e-6■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.91e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.791e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.781e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.641e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.51e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.391e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)16.86■□□□□ 0.291e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.151e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.071e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.061e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.041e-8■■■□□ 15.6
Retrieved 100 of 1,659 protein–RNA pairs in 41.9 ms