Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
EEA1Q15075 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
EEA1Q15075 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
EEA1Q15075 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.25■■■■■ 4.67
EEA1Q15075 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
EEA1Q15075 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC44.24■■■■■ 4.67
EEA1Q15075 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
EEA1Q15075 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
EEA1Q15075 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC44.2■■■■■ 4.67
EEA1Q15075 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
EEA1Q15075 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
EEA1Q15075 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
EEA1Q15075 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
EEA1Q15075 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
EEA1Q15075 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
EEA1Q15075 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
EEA1Q15075 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
EEA1Q15075 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
EEA1Q15075 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
EEA1Q15075 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
EEA1Q15075 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
EEA1Q15075 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.64
EEA1Q15075 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
EEA1Q15075 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
EEA1Q15075 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
EEA1Q15075 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
EEA1Q15075 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
EEA1Q15075 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
EEA1Q15075 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
EEA1Q15075 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
EEA1Q15075 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
EEA1Q15075 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
EEA1Q15075 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
EEA1Q15075 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
EEA1Q15075 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
EEA1Q15075 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
EEA1Q15075 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
EEA1Q15075 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
EEA1Q15075 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
EEA1Q15075 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.95■■■■■ 4.63
EEA1Q15075 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.89■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
EEA1Q15075 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
EEA1Q15075 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
EEA1Q15075 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC43.82■■■■■ 4.6
EEA1Q15075 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
EEA1Q15075 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.8■■■■■ 4.6
EEA1Q15075 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
EEA1Q15075 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
EEA1Q15075 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
EEA1Q15075 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
EEA1Q15075 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
EEA1Q15075 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
EEA1Q15075 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
EEA1Q15075 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
EEA1Q15075 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
EEA1Q15075 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
EEA1Q15075 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
EEA1Q15075 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
EEA1Q15075 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms