Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINS1Q14691 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINS1Q14691 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GINS1Q14691 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINS1Q14691 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS1Q14691 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GINS1Q14691 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GINS1Q14691 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
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