Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SF3B2Q13435 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SF3B2Q13435 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SF3B2Q13435 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SF3B2Q13435 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SF3B2Q13435 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SF3B2Q13435 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SF3B2Q13435 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SF3B2Q13435 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SF3B2Q13435 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SF3B2Q13435 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SF3B2Q13435 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SF3B2Q13435 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SF3B2Q13435 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SF3B2Q13435 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SF3B2Q13435 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SF3B2Q13435 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SF3B2Q13435 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SF3B2Q13435 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SF3B2Q13435 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SF3B2Q13435 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SF3B2Q13435 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SF3B2Q13435 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SF3B2Q13435 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SF3B2Q13435 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SF3B2Q13435 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SF3B2Q13435 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SF3B2Q13435 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SF3B2Q13435 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SF3B2Q13435 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SF3B2Q13435 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SF3B2Q13435 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SF3B2Q13435 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SF3B2Q13435 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SF3B2Q13435 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SF3B2Q13435 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SF3B2Q13435 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SF3B2Q13435 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
SF3B2Q13435 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SF3B2Q13435 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SF3B2Q13435 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SF3B2Q13435 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SF3B2Q13435 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SF3B2Q13435 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SF3B2Q13435 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SF3B2Q13435 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SF3B2Q13435 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SF3B2Q13435 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SF3B2Q13435 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SF3B2Q13435 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SF3B2Q13435 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SF3B2Q13435 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
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