Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.712e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 METAP2-207ENST00000549502 513 ntTSL 44.26□□□□□ -1.732e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.842e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.27□□□□□ -2.052e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.082e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.778e-7■■■■□ 25.6
SRSF9Q13242 AL109613.1-203ENST00000417401 504 ntTSL 37.76□□□□□ -1.178e-7■■■■□ 25.6
SRSF9Q13242 AL109613.1-205ENST00000446684 714 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.378e-7■■■■□ 25.6
SRSF9Q13242 AL109613.1-204ENST00000412628 172 ntTSL 33.75□□□□□ -1.818e-7■■■■□ 25.6
SRSF9Q13242 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.921e-20■■■■□ 25.6
SRSF9Q13242 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.161e-20■■■■□ 25.6
SRSF9Q13242 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.741e-9■■■■□ 25.4
SRSF9Q13242 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.051e-9■■■■□ 25.4
SRSF9Q13242 FNDC3B-207ENST00000469491 2916 ntTSL 211.97□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 25.4
SRSF9Q13242 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 25.4
SRSF9Q13242 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 25.4
SRSF9Q13242 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 25.4
SRSF9Q13242 SNTB1-203ENST00000519177 1962 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.291e-6■■■■□ 25.4
SRSF9Q13242 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.341e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.991e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 HSPA8-215ENST00000532091 2301 ntTSL 58.77□□□□□ -1.011e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.051e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.061e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.091e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)8.07□□□□□ -1.121e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 HSPA8-207ENST00000526110 1924 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.131e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.221e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 HSPA8-220ENST00000533238 465 ntTSL 33.91□□□□□ -1.781e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 HSPA8-209ENST00000526862 504 ntTSL 32.88□□□□□ -1.951e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.481e-45■■■■□ 25.2
SRSF9Q13242 GABPB1-AS1-204ENST00000560359 709 ntTSL 214.69□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 25
SRSF9Q13242 GABPB1-AS1-206ENST00000619314 1076 nt13.87□□□□□ -0.192e-7■■■■□ 25
SRSF9Q13242 HNF4A-203ENST00000372920 3340 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.233e-7■■■■□ 25
SRSF9Q13242 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.763e-7■■■■□ 25
SRSF9Q13242 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-7■■■■□ 25
SRSF9Q13242 HNF4A-209ENST00000619550 4763 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.913e-7■■■■□ 25
SRSF9Q13242 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.933e-7■■■■□ 25
SRSF9Q13242 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.123e-7■■■■□ 25
SRSF9Q13242 GABPB1-AS1-201ENST00000499326 717 ntTSL 24.9□□□□□ -1.632e-7■■■■□ 25
SRSF9Q13242 GABPB1-AS1-205ENST00000561289 554 ntTSL 34.45□□□□□ -1.72e-7■■■■□ 25
SRSF9Q13242 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.82e-7■■■■□ 25
SRSF9Q13242 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.822e-7■■■■□ 24.9
SRSF9Q13242 GATS-202ENST00000414739 2007 ntTSL 1 (best)18.23■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 24.9
SRSF9Q13242 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 24.9
SRSF9Q13242 GATS-204ENST00000435519 1306 ntTSL 217.47■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 24.9
SRSF9Q13242 GATS-211ENST00000543273 2840 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 24.9
SRSF9Q13242 GATS-201ENST00000328453 3526 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 24.9
SRSF9Q13242 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 24.9
SRSF9Q13242 GATS-207ENST00000440058 554 ntTSL 27.12□□□□□ -1.272e-6■■■■□ 24.9
SRSF9Q13242 GATS-206ENST00000437485 443 ntTSL 56.47□□□□□ -1.372e-6■■■■□ 24.9
SRSF9Q13242 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.551e-7■■■■□ 24.7
SRSF9Q13242 SNX6-210ENST00000557341 559 ntTSL 58.75□□□□□ -1.011e-7■■■■□ 24.7
SRSF9Q13242 SNX6-206ENST00000556162 1855 ntTSL 28.72□□□□□ -1.011e-7■■■■□ 24.7
SRSF9Q13242 SNX6-203ENST00000555416 1215 ntTSL 1 (best)8.42□□□□□ -1.061e-7■■■■□ 24.7
SRSF9Q13242 SNX6-207ENST00000556303 539 ntTSL 27.83□□□□□ -1.161e-7■■■■□ 24.7
SRSF9Q13242 SNX6-209ENST00000557265 725 ntTSL 37.65□□□□□ -1.181e-7■■■■□ 24.7
SRSF9Q13242 SNX6-201ENST00000362031 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.321e-7■■■■□ 24.7
SRSF9Q13242 SNX6-208ENST00000556712 851 ntTSL 56.36□□□□□ -1.391e-7■■■■□ 24.7
SRSF9Q13242 TRAPPC12-215ENST00000469147 1002 ntTSL 35.9□□□□□ -1.464e-7■■■■□ 24.7
SRSF9Q13242 GCNT2-215ENST00000489819 409 ntTSL 1 (best)8.92□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-205ENST00000410107 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.283e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-212ENST00000485764 608 ntTSL 56.9□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.363e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-214ENST00000489225 932 ntTSL 1 (best)6.31□□□□□ -1.43e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.553e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-206ENST00000459872 779 ntTSL 35.21□□□□□ -1.583e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-204ENST00000397423 3528 ntTSL 1 (best)4.64□□□□□ -1.673e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-207ENST00000461400 320 ntTSL 34.56□□□□□ -1.683e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.683e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-208ENST00000474518 580 ntTSL 43.4□□□□□ -1.873e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 GCNT2-210ENST00000475577 547 ntTSL 42.99□□□□□ -1.933e-6■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.991e-13■■■■□ 24.6
SRSF9Q13242 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.217e-8■■■■□ 24.5
SRSF9Q13242 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 24.5
SRSF9Q13242 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.16e-7■■■■□ 24.5
SRSF9Q13242 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.496e-7■■■■□ 24.5
SRSF9Q13242 SET-202ENST00000372686 1029 ntTSL 23.6□□□□□ -1.836e-7■■■■□ 24.5
SRSF9Q13242 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.056e-7■■■■□ 24.5
SRSF9Q13242 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.34e-6■■■■□ 24.4
SRSF9Q13242 LINC00969-201ENST00000414625 729 ntTSL 59.68□□□□□ -0.862e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-313ENST00000628917 490 ntTSL 58.65□□□□□ -1.022e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.022e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-244ENST00000602127 749 ntTSL 58.65□□□□□ -1.022e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-217ENST00000451982 1161 ntTSL 58.46□□□□□ -1.062e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.142e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-285ENST00000627152 846 ntTSL 57.86□□□□□ -1.152e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.152e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-320ENST00000629823 869 ntTSL 57.44□□□□□ -1.222e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-236ENST00000599448 780 ntTSL 57.41□□□□□ -1.222e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-342ENST00000631366 751 ntTSL 57.41□□□□□ -1.222e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-336ENST00000631189 1156 ntTSL 57.29□□□□□ -1.242e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-312ENST00000628823 616 ntTSL 57.09□□□□□ -1.272e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-204ENST00000420851 868 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.292e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-235ENST00000598992 1005 ntTSL 56.99□□□□□ -1.292e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-296ENST00000627718 510 ntTSL 56.99□□□□□ -1.292e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-331ENST00000630863 954 ntTSL 56.88□□□□□ -1.312e-7■■■■□ 24.3
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