RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.56■■■■■ 6.81
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.8■■■■■ 5.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.71■■■■■ 5.23
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.68■■■■■ 5.22
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SCRIBQ14160 1630 aa46.58■■■■■ 5.05
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.91■■■■■ 4.94
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.78■■■■■ 4.76
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.77■■■■■ 4.76
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SMARCA2P51531 1590 aa44.21■■■■■ 4.67
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.21■■■■■ 4.67
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.17■■■■■ 4.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NCAPD3P42695 1498 aa44.1■■■■■ 4.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HMGXB3Q12766 1538 aa43.99■■■■■ 4.63
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WIZO95785 1651 aa43.95■■■■■ 4.63
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NESP48681 1621 aa42.91■■■■■ 4.46
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.83■■■■■ 4.45
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ERCC6Q03468 1493 aa42.58■■■■■ 4.41
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.56■■■■■ 4.4
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.5■■■■■ 4.39
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.36■■■■■ 4.37
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.28■■■■■ 4.36
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WDR62O43379 1518 aa42■■■■■ 4.31
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CUX2O14529 1486 aa41.98■■■■■ 4.31
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.77■■■■■ 4.28
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TOPBP1Q92547 1522 aa41.75■■■■■ 4.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CUX1P39880 1505 aa41.6■■■■■ 4.25
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.23
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.4■■■■■ 4.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TOP2BQ02880 1626 aa41.4■■■■■ 4.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IFT140Q96RY7 1462 aa41.38■■■■■ 4.21
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.21■■■■■ 4.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.18
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WDR97A6NE52 1622 aa41.11■■■■■ 4.17
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.02■■■■■ 4.16
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PBRM1Q86U86 1689 aa40.76■■■■■ 4.12
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GRIN2BQ13224 1484 aa40.72■■■■■ 4.11
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.62■■■■■ 4.09
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CHD1O14646 1710 aa40.47■■■■■ 4.07
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SYNJ2O15056 1496 aa40.41■■■■■ 4.06
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.35■■■■■ 4.05
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GRIN2AQ12879 1464 aa40.2■■■■■ 4.03
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EEA1Q15075 1411 aa40.13■■■■■ 4.01
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.11■■■■■ 4.01
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.09■■■■■ 4.01
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CEP170Q5SW79 1584 aa40.01■■■■□ 3.99
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.01■■■■□ 3.99
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NUP160Q12769 1436 aa40■■■■□ 3.99
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.95■■■■□ 3.99
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.95■■■■□ 3.99
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRXQ9BXM0 1461 aa39.93■■■■□ 3.98
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.73■■■■□ 3.95
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIF21BO75037 1637 aa39.72■■■■□ 3.95
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