RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435519.6

GATS-204, Transcript of Putative protein GATS, humanhuman

TSL 2

Gene GATS, Length 1,306 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATS-204ENST00000435519 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.93■■■■■ 8.46
GATS-204ENST00000435519 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.23■■■■■ 7.23
GATS-204ENST00000435519 ABCC9O60706 1549 aa57.99■■■■■ 6.87
GATS-204ENST00000435519 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.74■■■■■ 6.67
GATS-204ENST00000435519 NACADO15069 1562 aa56.41■■■■■ 6.62
GATS-204ENST00000435519 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.4■■■■■ 6.62
GATS-204ENST00000435519 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.37■■■■■ 6.61
GATS-204ENST00000435519 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.27■■■■■ 6.6
GATS-204ENST00000435519 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.18■■■■■ 6.58
GATS-204ENST00000435519 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.02■■■■■ 6.4
GATS-204ENST00000435519 SCRIBQ14160 1630 aa54.78■■■■■ 6.36
GATS-204ENST00000435519 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.5■■■■■ 6.32
GATS-204ENST00000435519 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.22■■■■■ 6.27
GATS-204ENST00000435519 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.18■■■■■ 6.26
GATS-204ENST00000435519 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.01■■■■■ 6.08
GATS-204ENST00000435519 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.73■■■■■ 6.03
GATS-204ENST00000435519 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.64■■■■■ 6.02
GATS-204ENST00000435519 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.6■■■■■ 6.01
GATS-204ENST00000435519 SMARCA4P51532 1647 aa52.57■■■■■ 6.01
GATS-204ENST00000435519 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.56■■■■■ 6
GATS-204ENST00000435519 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.29■■■■■ 5.96
GATS-204ENST00000435519 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.15■■■■■ 5.94
GATS-204ENST00000435519 SMARCA2P51531 1590 aa52.12■■■■■ 5.93
GATS-204ENST00000435519 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.08■■■■■ 5.93
GATS-204ENST00000435519 NCAPD3P42695 1498 aa52.01■■■■■ 5.92
GATS-204ENST00000435519 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.96■■■■■ 5.91
GATS-204ENST00000435519 HMGXB3Q12766 1538 aa51.86■■■■■ 5.89
GATS-204ENST00000435519 WIZO95785 1651 aa51.77■■■■■ 5.88
GATS-204ENST00000435519 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.68■■■■■ 5.86
GATS-204ENST00000435519 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.33■■■■■ 5.81
GATS-204ENST00000435519 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.94■■■■■ 5.75
GATS-204ENST00000435519 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.66■■■■■ 5.7
GATS-204ENST00000435519 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.56■■■■■ 5.68
GATS-204ENST00000435519 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.48■■■■■ 5.67
GATS-204ENST00000435519 NESP48681 1621 aa50.39■■■■■ 5.66
GATS-204ENST00000435519 CFTRP13569 1480 aa50.36■■■■■ 5.65
GATS-204ENST00000435519 PRDM2Q13029 1718 aa50.16■■■■■ 5.62
GATS-204ENST00000435519 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.13■■■■■ 5.62
GATS-204ENST00000435519 ERCC6Q03468 1493 aa49.97■■■■■ 5.59
GATS-204ENST00000435519 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.93■■■■■ 5.58
GATS-204ENST00000435519 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.87■■■■■ 5.57
GATS-204ENST00000435519 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.77■■■■■ 5.56
GATS-204ENST00000435519 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.62■■■■■ 5.53
GATS-204ENST00000435519 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.56■■■■■ 5.52
GATS-204ENST00000435519 WDR62O43379 1518 aa49.42■■■■■ 5.5
GATS-204ENST00000435519 CUX2O14529 1486 aa49.33■■■■■ 5.49
GATS-204ENST00000435519 ABCC8Q09428 1581 aa49.32■■■■■ 5.49
GATS-204ENST00000435519 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.32■■■■■ 5.49
GATS-204ENST00000435519 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.22■■■■■ 5.47
GATS-204ENST00000435519 TOPBP1Q92547 1522 aa49.16■■■■■ 5.46
GATS-204ENST00000435519 CUX1P39880 1505 aa49.03■■■■■ 5.44
GATS-204ENST00000435519 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.97■■■■■ 5.43
GATS-204ENST00000435519 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.88■■■■■ 5.42
GATS-204ENST00000435519 TOP2BQ02880 1626 aa48.87■■■■■ 5.41
GATS-204ENST00000435519 SYNJ1O43426 1573 aa48.81■■■■■ 5.4
GATS-204ENST00000435519 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.79■■■■■ 5.4
GATS-204ENST00000435519 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.75■■■■■ 5.39
GATS-204ENST00000435519 IFT140Q96RY7 1462 aa48.72■■■■■ 5.39
GATS-204ENST00000435519 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.63■■■■■ 5.38
GATS-204ENST00000435519 SOGA1O94964 1423 aa48.57■■■■■ 5.37
GATS-204ENST00000435519 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.48■■■■■ 5.35
GATS-204ENST00000435519 WDR97A6NE52 1622 aa48.43■■■■■ 5.34
GATS-204ENST00000435519 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.38■■■■■ 5.34
GATS-204ENST00000435519 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.34■■■■■ 5.33
GATS-204ENST00000435519 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.27■■■■■ 5.32
GATS-204ENST00000435519 TRIM41Q8WV44 630 aa48.19■■■■■ 5.3
GATS-204ENST00000435519 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.15■■■■■ 5.3
GATS-204ENST00000435519 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.15■■■■■ 5.3
GATS-204ENST00000435519 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.14■■■■■ 5.3
GATS-204ENST00000435519 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.05■■■■■ 5.28
GATS-204ENST00000435519 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.05■■■■■ 5.28
GATS-204ENST00000435519 GRIN2BQ13224 1484 aa47.98■■■■■ 5.27
GATS-204ENST00000435519 PBRM1Q86U86 1689 aa47.96■■■■■ 5.27
GATS-204ENST00000435519 KIF27Q86VH2 1401 aa47.92■■■■■ 5.26
GATS-204ENST00000435519 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.85■■■■■ 5.25
GATS-204ENST00000435519 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.83■■■■■ 5.25
GATS-204ENST00000435519 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.75■■■■■ 5.23
GATS-204ENST00000435519 IGF1RP08069 1367 aa47.6■■■■■ 5.21
GATS-204ENST00000435519 ADAMTS12P58397 1594 aa47.6■■■■■ 5.21
GATS-204ENST00000435519 SYNJ2O15056 1496 aa47.59■■■■■ 5.21
GATS-204ENST00000435519 CUL7Q14999 1698 aa47.57■■■■■ 5.21
GATS-204ENST00000435519 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.56■■■■■ 5.2
GATS-204ENST00000435519 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.54■■■■■ 5.2
GATS-204ENST00000435519 CHD1O14646 1710 aa47.54■■■■■ 5.2
GATS-204ENST00000435519 EEA1Q15075 1411 aa47.53■■■■■ 5.2
GATS-204ENST00000435519 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
GATS-204ENST00000435519 GRIN2AQ12879 1464 aa47.35■■■■■ 5.17
GATS-204ENST00000435519 FBLN2P98095 1184 aa47.33■■■■■ 5.17
GATS-204ENST00000435519 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.33■■■■■ 5.17
GATS-204ENST00000435519 OSCARQ8IYS5 282 aa47.31■■■■■ 5.16
GATS-204ENST00000435519 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.23■■■■■ 5.15
GATS-204ENST00000435519 PRXQ9BXM0 1461 aa47.19■■■■■ 5.14
GATS-204ENST00000435519 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.16■■■■■ 5.14
GATS-204ENST00000435519 NUP160Q12769 1436 aa47.15■■■■■ 5.14
GATS-204ENST00000435519 CEP170Q5SW79 1584 aa47.07■■■■■ 5.13
GATS-204ENST00000435519 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.06■■■■■ 5.12
GATS-204ENST00000435519 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
GATS-204ENST00000435519 KIF21BO75037 1637 aa46.98■■■■■ 5.11
GATS-204ENST00000435519 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.92■■■■■ 5.1
GATS-204ENST00000435519 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.86■■■■■ 5.09
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