RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499326.1

GABPB1-AS1-201, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 717 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
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GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CUX2O14529 1486 aa16.48■□□□□ 0.23
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ERCC6Q03468 1493 aa16.37■□□□□ 0.21
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GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SMARCA4P51532 1647 aa16.01■□□□□ 0.15
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GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.94■□□□□ 0.14
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GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KCNA4P22459 653 aa15.61■□□□□ 0.09
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.57■□□□□ 0.08
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 WIZO95785 1651 aa15.52■□□□□ 0.08
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GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.52■□□□□ 0.08
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.52■□□□□ 0.08
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GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CFTRP13569 1480 aa15.48■□□□□ 0.07
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GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
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GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
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GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ARAP1Q96P48 1450 aa15.26■□□□□ 0.03
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TOPBP1Q92547 1522 aa15.22■□□□□ 0.03
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PRDM2Q13029 1718 aa15.22■□□□□ 0.03
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CHD1O14646 1710 aa15.19■□□□□ 0.02
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.023e-72■■■■■ 35.3
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GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ABCC8Q09428 1581 aa15.13■□□□□ 0.01
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.11■□□□□ 0.01
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.02■□□□□ -0
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.01□□□□□ -0.01
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.99□□□□□ -0.01
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SOGA1O94964 1423 aa14.97□□□□□ -0.01
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SYNJ1O43426 1573 aa14.95□□□□□ -0.02
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 WDR97A6NE52 1622 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.89□□□□□ -0.03
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