Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TROQ12816 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TROQ12816 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TROQ12816 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
TROQ12816 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
TROQ12816 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.94■■■■■ 4.3
TROQ12816 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TROQ12816 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
TROQ12816 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TROQ12816 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TROQ12816 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
TROQ12816 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
TROQ12816 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
TROQ12816 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
TROQ12816 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TROQ12816 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TROQ12816 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TROQ12816 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
TROQ12816 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
TROQ12816 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TROQ12816 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TROQ12816 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TROQ12816 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TROQ12816 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
TROQ12816 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
TROQ12816 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
TROQ12816 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
TROQ12816 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TROQ12816 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TROQ12816 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TROQ12816 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TROQ12816 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TROQ12816 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TROQ12816 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
TROQ12816 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
TROQ12816 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TROQ12816 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
TROQ12816 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TROQ12816 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
TROQ12816 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
TROQ12816 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TROQ12816 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.72■■■■■ 4.27
TROQ12816 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TROQ12816 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
TROQ12816 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TROQ12816 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TROQ12816 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TROQ12816 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
TROQ12816 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
TROQ12816 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
TROQ12816 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
TROQ12816 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TROQ12816 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
TROQ12816 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
TROQ12816 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TROQ12816 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TROQ12816 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
TROQ12816 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
TROQ12816 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TROQ12816 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TROQ12816 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
TROQ12816 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TROQ12816 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TROQ12816 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
TROQ12816 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
TROQ12816 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
TROQ12816 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
TROQ12816 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TROQ12816 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
TROQ12816 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
TROQ12816 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
TROQ12816 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
TROQ12816 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
TROQ12816 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
TROQ12816 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
TROQ12816 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.49■■■■■ 4.23
TROQ12816 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TROQ12816 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TROQ12816 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TROQ12816 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
TROQ12816 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
TROQ12816 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TROQ12816 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TROQ12816 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TROQ12816 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TROQ12816 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TROQ12816 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
TROQ12816 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.23
TROQ12816 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
TROQ12816 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TROQ12816 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
TROQ12816 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
TROQ12816 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TROQ12816 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
TROQ12816 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
TROQ12816 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TROQ12816 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TROQ12816 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TROQ12816 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TROQ12816 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
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