Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LMOD3Q0VAK6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMOD3Q0VAK6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMOD3Q0VAK6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LMOD3Q0VAK6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LMOD3Q0VAK6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LMOD3Q0VAK6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMOD3Q0VAK6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LMOD3Q0VAK6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LMOD3Q0VAK6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LMOD3Q0VAK6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMOD3Q0VAK6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LMOD3Q0VAK6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
LMOD3Q0VAK6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMOD3Q0VAK6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMOD3Q0VAK6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMOD3Q0VAK6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMOD3Q0VAK6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMOD3Q0VAK6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMOD3Q0VAK6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
LMOD3Q0VAK6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LMOD3Q0VAK6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
LMOD3Q0VAK6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
LMOD3Q0VAK6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LMOD3Q0VAK6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms