Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOX4Q06945 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOX4Q06945 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOX4Q06945 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOX4Q06945 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOX4Q06945 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOX4Q06945 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SOX4Q06945 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SOX4Q06945 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SOX4Q06945 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX4Q06945 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX4Q06945 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX4Q06945 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms