Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSX2P58304 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSX2P58304 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSX2P58304 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSX2P58304 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSX2P58304 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSX2P58304 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSX2P58304 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSX2P58304 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSX2P58304 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSX2P58304 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSX2P58304 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSX2P58304 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VSX2P58304 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSX2P58304 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSX2P58304 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSX2P58304 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSX2P58304 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSX2P58304 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSX2P58304 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSX2P58304 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSX2P58304 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSX2P58304 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSX2P58304 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSX2P58304 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSX2P58304 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSX2P58304 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSX2P58304 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSX2P58304 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSX2P58304 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSX2P58304 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSX2P58304 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSX2P58304 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSX2P58304 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSX2P58304 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSX2P58304 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSX2P58304 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSX2P58304 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSX2P58304 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSX2P58304 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSX2P58304 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSX2P58304 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSX2P58304 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSX2P58304 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VSX2P58304 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSX2P58304 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSX2P58304 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSX2P58304 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSX2P58304 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSX2P58304 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSX2P58304 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSX2P58304 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSX2P58304 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSX2P58304 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSX2P58304 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSX2P58304 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSX2P58304 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSX2P58304 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSX2P58304 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSX2P58304 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSX2P58304 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSX2P58304 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSX2P58304 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSX2P58304 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSX2P58304 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSX2P58304 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSX2P58304 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSX2P58304 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSX2P58304 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSX2P58304 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSX2P58304 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSX2P58304 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSX2P58304 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSX2P58304 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSX2P58304 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSX2P58304 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSX2P58304 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSX2P58304 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSX2P58304 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSX2P58304 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSX2P58304 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSX2P58304 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSX2P58304 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSX2P58304 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSX2P58304 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSX2P58304 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSX2P58304 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSX2P58304 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSX2P58304 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSX2P58304 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSX2P58304 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSX2P58304 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VSX2P58304 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSX2P58304 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSX2P58304 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSX2P58304 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSX2P58304 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSX2P58304 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSX2P58304 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSX2P58304 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms