Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN15P56746 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN15P56746 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN15P56746 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN15P56746 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLDN15P56746 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms