Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MTHFSP49914 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
MTHFSP49914 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MTHFSP49914 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MTHFSP49914 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MTHFSP49914 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
MTHFSP49914 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MTHFSP49914 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MTHFSP49914 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
MTHFSP49914 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
MTHFSP49914 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
MTHFSP49914 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MTHFSP49914 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MTHFSP49914 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
MTHFSP49914 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
MTHFSP49914 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
MTHFSP49914 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MTHFSP49914 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MTHFSP49914 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MTHFSP49914 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
MTHFSP49914 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MTHFSP49914 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
MTHFSP49914 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
MTHFSP49914 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MTHFSP49914 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MTHFSP49914 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MTHFSP49914 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MTHFSP49914 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MTHFSP49914 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MTHFSP49914 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
MTHFSP49914 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
MTHFSP49914 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MTHFSP49914 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
MTHFSP49914 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms