Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSC2P49815 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSC2P49815 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSC2P49815 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSC2P49815 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSC2P49815 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSC2P49815 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSC2P49815 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSC2P49815 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSC2P49815 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSC2P49815 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSC2P49815 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSC2P49815 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSC2P49815 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSC2P49815 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSC2P49815 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSC2P49815 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSC2P49815 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSC2P49815 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSC2P49815 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSC2P49815 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSC2P49815 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSC2P49815 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSC2P49815 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TSC2P49815 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSC2P49815 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSC2P49815 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSC2P49815 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSC2P49815 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSC2P49815 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSC2P49815 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSC2P49815 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSC2P49815 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSC2P49815 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSC2P49815 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSC2P49815 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSC2P49815 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSC2P49815 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSC2P49815 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSC2P49815 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSC2P49815 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSC2P49815 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSC2P49815 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSC2P49815 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSC2P49815 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSC2P49815 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSC2P49815 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSC2P49815 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSC2P49815 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSC2P49815 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSC2P49815 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSC2P49815 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSC2P49815 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSC2P49815 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSC2P49815 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSC2P49815 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSC2P49815 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSC2P49815 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSC2P49815 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSC2P49815 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSC2P49815 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSC2P49815 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSC2P49815 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSC2P49815 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSC2P49815 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSC2P49815 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSC2P49815 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSC2P49815 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSC2P49815 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSC2P49815 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSC2P49815 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSC2P49815 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSC2P49815 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSC2P49815 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSC2P49815 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSC2P49815 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSC2P49815 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TSC2P49815 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TSC2P49815 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSC2P49815 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSC2P49815 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSC2P49815 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSC2P49815 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSC2P49815 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSC2P49815 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSC2P49815 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSC2P49815 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TSC2P49815 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSC2P49815 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSC2P49815 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSC2P49815 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSC2P49815 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSC2P49815 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSC2P49815 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSC2P49815 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSC2P49815 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSC2P49815 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSC2P49815 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSC2P49815 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSC2P49815 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms