Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PIP4K2AP48426 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PIP4K2AP48426 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PIP4K2AP48426 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PIP4K2AP48426 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PIP4K2AP48426 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PIP4K2AP48426 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PIP4K2AP48426 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PIP4K2AP48426 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PIP4K2AP48426 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIP4K2AP48426 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PIP4K2AP48426 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PIP4K2AP48426 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PIP4K2AP48426 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIP4K2AP48426 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PIP4K2AP48426 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIP4K2AP48426 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PIP4K2AP48426 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIP4K2AP48426 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIP4K2AP48426 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIP4K2AP48426 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIP4K2AP48426 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PIP4K2AP48426 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PIP4K2AP48426 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PIP4K2AP48426 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIP4K2AP48426 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PIP4K2AP48426 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PIP4K2AP48426 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIP4K2AP48426 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PIP4K2AP48426 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PIP4K2AP48426 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIP4K2AP48426 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIP4K2AP48426 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIP4K2AP48426 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIP4K2AP48426 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PIP4K2AP48426 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PIP4K2AP48426 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PIP4K2AP48426 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PIP4K2AP48426 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIP4K2AP48426 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PIP4K2AP48426 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PIP4K2AP48426 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PIP4K2AP48426 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PIP4K2AP48426 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PIP4K2AP48426 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIP4K2AP48426 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIP4K2AP48426 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PIP4K2AP48426 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PIP4K2AP48426 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174 ms