Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RANBP1P43487 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANBP1P43487 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RANBP1P43487 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RANBP1P43487 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RANBP1P43487 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP1P43487 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP1P43487 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP1P43487 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP1P43487 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANBP1P43487 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANBP1P43487 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP1P43487 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms