Protein–RNA interactions for Protein: P34931

HSPA1L, Heat shock 70 kDa protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA1LP34931 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
HSPA1LP34931 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
HSPA1LP34931 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
HSPA1LP34931 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
HSPA1LP34931 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
HSPA1LP34931 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HSPA1LP34931 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HSPA1LP34931 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
HSPA1LP34931 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
HSPA1LP34931 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
HSPA1LP34931 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
HSPA1LP34931 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HSPA1LP34931 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
HSPA1LP34931 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
HSPA1LP34931 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HSPA1LP34931 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
HSPA1LP34931 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
HSPA1LP34931 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HSPA1LP34931 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HSPA1LP34931 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
HSPA1LP34931 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
HSPA1LP34931 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
HSPA1LP34931 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HSPA1LP34931 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HSPA1LP34931 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
HSPA1LP34931 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
HSPA1LP34931 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HSPA1LP34931 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HSPA1LP34931 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HSPA1LP34931 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
HSPA1LP34931 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HSPA1LP34931 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
HSPA1LP34931 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HSPA1LP34931 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HSPA1LP34931 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
HSPA1LP34931 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.6
HSPA1LP34931 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms