Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SSFA2P28290 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SSFA2P28290 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SSFA2P28290 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SSFA2P28290 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SSFA2P28290 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SSFA2P28290 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SSFA2P28290 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SSFA2P28290 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SSFA2P28290 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SSFA2P28290 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SSFA2P28290 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SSFA2P28290 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SSFA2P28290 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SSFA2P28290 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SSFA2P28290 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SSFA2P28290 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SSFA2P28290 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SSFA2P28290 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SSFA2P28290 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SSFA2P28290 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SSFA2P28290 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SSFA2P28290 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SSFA2P28290 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SSFA2P28290 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SSFA2P28290 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SSFA2P28290 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SSFA2P28290 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SSFA2P28290 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SSFA2P28290 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SSFA2P28290 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SSFA2P28290 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SSFA2P28290 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.1 ms