Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PTPRK-219ENST00000531050 2515 ntTSL 1 (best)7.45□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CEP192-211ENST00000513432 8635 ntTSL 1 (best)7.24□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 HACD2-203ENST00000471236 403 ntTSL 37.18□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CEP192-214ENST00000589596 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 26.75□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PUM2-209ENST00000440577 4352 ntTSL 1 (best)6.27□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CEP192-209ENST00000511820 6455 ntTSL 1 (best)6.21□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PTPRK-209ENST00000415046 1029 ntTSL 55.53□□□□□ -1.521e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.681e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 ADD2-210ENST00000456320 997 ntTSL 516.14■□□□□ 0.171e-11■■■■■ 59.1
DDX6P26196 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-11■■■■■ 59.1
DDX6P26196 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.81e-11■■■■■ 59.1
DDX6P26196 ADD2-205ENST00000413157 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-11■■■■■ 59.1
DDX6P26196 ADD2-214ENST00000522886 874 ntTSL 59.52□□□□□ -0.891e-11■■■■■ 59.1
DDX6P26196 ADD2-203ENST00000403045 3745 ntTSL 29.04□□□□□ -0.961e-11■■■■■ 59.1
DDX6P26196 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.061e-11■■■■■ 59.1
DDX6P26196 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 58.6
DDX6P26196 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.512e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-207ENST00000456097 1138 ntTSL 512.23□□□□□ -0.452e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-210ENST00000525198 981 ntTSL 512.08□□□□□ -0.482e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-217ENST00000527423 962 ntTSL 411.06□□□□□ -0.642e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.652e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.712e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-218ENST00000527659 2436 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-208ENST00000524581 3090 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.732e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.782e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-215ENST00000527017 727 ntTSL 59.97□□□□□ -0.812e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.832e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.022e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.122e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.32e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.412e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.492e-12■■■■■ 58.2
DDX6P26196 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.176e-10■■■■■ 57.9
DDX6P26196 AQP3-205ENST00000494313 1505 ntTSL 214.59□□□□□ -0.076e-10■■■■■ 57.9
DDX6P26196 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.346e-10■■■■■ 57.9
DDX6P26196 AQP3-204ENST00000493581 2911 ntTSL 212.31□□□□□ -0.446e-10■■■■■ 57.9
DDX6P26196 ADGRD1-203ENST00000376682 4135 ntTSL 211.49□□□□□ -0.576e-10■■■■■ 57.9
DDX6P26196 ADGRD1-205ENST00000535015 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.836e-10■■■■■ 57.9
DDX6P26196 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.49■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 57
DDX6P26196 ATP9B-207ENST00000586672 583 ntTSL 415.2■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 57
DDX6P26196 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 57
DDX6P26196 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 57
DDX6P26196 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)9.97□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 57
DDX6P26196 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 57
DDX6P26196 ATP9B-206ENST00000586366 2845 ntTSL 27.54□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 57
DDX6P26196 ATP9B-221ENST00000590271 1923 ntTSL 26.72□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 57
DDX6P26196 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-11■■■■■ 56.8
DDX6P26196 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.271e-11■■■■■ 56.8
DDX6P26196 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.91e-11■■■■■ 56.8
DDX6P26196 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-207ENST00000562155 1757 ntTSL 520.64■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-202ENST00000316853 1287 ntTSL 1 (best)19.25■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-215ENST00000566349 1377 ntTSL 218.21■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-217ENST00000566661 2232 ntTSL 516.97■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-208ENST00000562261 1065 ntTSL 316.28■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-212ENST00000564396 563 ntTSL 515.51■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-226ENST00000569747 560 ntTSL 414.64□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-214ENST00000565328 582 ntTSL 414.15□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 56.6
DDX6P26196 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 56.6
DDX6P26196 RAP1GAP-207ENST00000447293 429 ntTSL 212.11□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 56.6
DDX6P26196 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-213ENST00000564484 562 ntTSL 511.07□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 56.6
DDX6P26196 KLHDC4-219ENST00000567513 585 ntTSL 48.13□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 56.6
DDX6P26196 CCDC88A-203ENST00000412148 2880 ntTSL 1 (best)5.42□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 56.6
DDX6P26196 CCDC88A-205ENST00000426576 4500 ntTSL 1 (best)2.83□□□□□ -1.962e-6■■■■■ 56.6
DDX6P26196 CCDC88A-208ENST00000444458 4236 ntTSL 22.2□□□□□ -2.062e-6■■■■■ 56.6
DDX6P26196 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.015e-11■■■■■ 56.2
DDX6P26196 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.314e-74■■■■■ 56
DDX6P26196 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.244e-74■■■■■ 56
DDX6P26196 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.034e-74■■■■■ 56
DDX6P26196 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.974e-74■■■■■ 56
DDX6P26196 AC135050.2-201ENST00000533518 2362 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.052e-12■■■■■ 55.5
DDX6P26196 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-11■■■■■ 55.4
DDX6P26196 DDX3X-212ENST00000616050 818 ntTSL 512.03□□□□□ -0.482e-11■■■■■ 55.4
DDX6P26196 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 55.4
DDX6P26196 DDX3X-215ENST00000625837 3237 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-11■■■■■ 55.4
DDX6P26196 DDX3X-216ENST00000626301 3013 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-11■■■■■ 55.4
DDX6P26196 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.792e-11■■■■■ 55.4
DDX6P26196 DDX3X-220ENST00000630370 3120 ntTSL 59.41□□□□□ -0.92e-11■■■■■ 55.4
DDX6P26196 DDX3X-218ENST00000629785 3457 ntTSL 59.36□□□□□ -0.912e-11■■■■■ 55.4
DDX6P26196 DDX3X-219ENST00000630255 3289 ntTSL 59.11□□□□□ -0.952e-11■■■■■ 55.4
DDX6P26196 DDX3X-221ENST00000630858 3181 ntTSL 58.97□□□□□ -0.972e-11■■■■■ 55.4
DDX6P26196 DDX3X-204ENST00000478993 3397 ntTSL 1 (best)8.76□□□□□ -1.012e-11■■■■■ 55.4
DDX6P26196 NR1H2-208ENST00000597157 856 ntTSL 1 (best)17.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 55.2
DDX6P26196 MAP3K10-207ENST00000597986 2104 ntTSL 523.08■■□□□ 1.282e-8■■■■■ 54.7
DDX6P26196 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 54.7
DDX6P26196 FAM76B-211ENST00000543641 1379 ntTSL 1 (best)28.27■■■□□ 2.123e-9■■■■■ 54.1
DDX6P26196 FAM76B-212ENST00000545654 2001 ntTSL 224.95■■□□□ 1.583e-9■■■■■ 54.1
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