RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597157.1

NR1H2-208, Transcript of nuclear receptor subfamily 1 group H member 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NR1H2, Length 856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2-208ENST00000597157 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.45■■■■□ 3.91
NR1H2-208ENST00000597157 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.89■■■■□ 3.18
NR1H2-208ENST00000597157 ABCC9O60706 1549 aa33.89■■■■□ 3.02
NR1H2-208ENST00000597157 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.02■■■□□ 2.88
NR1H2-208ENST00000597157 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
NR1H2-208ENST00000597157 NACADO15069 1562 aa32.74■■■□□ 2.83
NR1H2-208ENST00000597157 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.72■■■□□ 2.83
NR1H2-208ENST00000597157 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.61■■■□□ 2.81
NR1H2-208ENST00000597157 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.6■■■□□ 2.81
NR1H2-208ENST00000597157 SCRIBQ14160 1630 aa31.94■■■□□ 2.7
NR1H2-208ENST00000597157 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.92■■■□□ 2.7
NR1H2-208ENST00000597157 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.76■■■□□ 2.67
NR1H2-208ENST00000597157 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.73■■■□□ 2.67
NR1H2-208ENST00000597157 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.64■■■□□ 2.65
NR1H2-208ENST00000597157 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.52■■■□□ 2.64
NR1H2-208ENST00000597157 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
NR1H2-208ENST00000597157 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.7■■■□□ 2.51
NR1H2-208ENST00000597157 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.62■■■□□ 2.49
NR1H2-208ENST00000597157 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
NR1H2-208ENST00000597157 SMARCA4P51532 1647 aa30.54■■■□□ 2.48
NR1H2-208ENST00000597157 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.41■■■□□ 2.46
NR1H2-208ENST00000597157 SMARCA2P51531 1590 aa30.28■■■□□ 2.44
NR1H2-208ENST00000597157 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.27■■■□□ 2.44
NR1H2-208ENST00000597157 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
NR1H2-208ENST00000597157 NCAPD3P42695 1498 aa30.19■■■□□ 2.42
NR1H2-208ENST00000597157 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.17■■■□□ 2.42
NR1H2-208ENST00000597157 WIZO95785 1651 aa30.12■■■□□ 2.41
NR1H2-208ENST00000597157 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
NR1H2-208ENST00000597157 HMGXB3Q12766 1538 aa30.07■■■□□ 2.4
NR1H2-208ENST00000597157 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
NR1H2-208ENST00000597157 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
NR1H2-208ENST00000597157 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.65■■■□□ 2.34
NR1H2-208ENST00000597157 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.48■■■□□ 2.31
NR1H2-208ENST00000597157 NESP48681 1621 aa29.4■■■□□ 2.3
NR1H2-208ENST00000597157 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.38■■■□□ 2.29
NR1H2-208ENST00000597157 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.36■■■□□ 2.29
NR1H2-208ENST00000597157 CFTRP13569 1480 aa29.23■■■□□ 2.27
NR1H2-208ENST00000597157 ERCC6Q03468 1493 aa29.23■■■□□ 2.27
NR1H2-208ENST00000597157 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.2■■■□□ 2.27
NR1H2-208ENST00000597157 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.05■■■□□ 2.24
NR1H2-208ENST00000597157 PRDM2Q13029 1718 aa29.04■■■□□ 2.24
NR1H2-208ENST00000597157 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.04■■■□□ 2.24
NR1H2-208ENST00000597157 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.99■■■□□ 2.23
NR1H2-208ENST00000597157 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.85■■■□□ 2.21
NR1H2-208ENST00000597157 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
NR1H2-208ENST00000597157 CUX2O14529 1486 aa28.79■■■□□ 2.2
NR1H2-208ENST00000597157 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
NR1H2-208ENST00000597157 WDR62O43379 1518 aa28.7■■■□□ 2.19
NR1H2-208ENST00000597157 ABCC8Q09428 1581 aa28.65■■■□□ 2.18
NR1H2-208ENST00000597157 TOPBP1Q92547 1522 aa28.61■■■□□ 2.17
NR1H2-208ENST00000597157 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.61■■■□□ 2.17
NR1H2-208ENST00000597157 CUX1P39880 1505 aa28.51■■■□□ 2.15
NR1H2-208ENST00000597157 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.51■■■□□ 2.15
NR1H2-208ENST00000597157 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.39■■■□□ 2.13
NR1H2-208ENST00000597157 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
NR1H2-208ENST00000597157 SYNJ1O43426 1573 aa28.37■■■□□ 2.13
NR1H2-208ENST00000597157 TOP2BQ02880 1626 aa28.36■■■□□ 2.13
NR1H2-208ENST00000597157 IFT140Q96RY7 1462 aa28.35■■■□□ 2.13
NR1H2-208ENST00000597157 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.34■■■□□ 2.13
NR1H2-208ENST00000597157 SOGA1O94964 1423 aa28.33■■■□□ 2.13
NR1H2-208ENST00000597157 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.28■■■□□ 2.12
NR1H2-208ENST00000597157 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
NR1H2-208ENST00000597157 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
NR1H2-208ENST00000597157 TRIM41Q8WV44 630 aa28.17■■■□□ 2.1
NR1H2-208ENST00000597157 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
NR1H2-208ENST00000597157 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.095e-8■■■■■ 37.7
NR1H2-208ENST00000597157 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.1■■■□□ 2.09
NR1H2-208ENST00000597157 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
NR1H2-208ENST00000597157 WDR97A6NE52 1622 aa28.06■■■□□ 2.08
NR1H2-208ENST00000597157 CHIC1Q5VXU3 224 aa28■■■□□ 2.07
NR1H2-208ENST00000597157 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.99■■■□□ 2.07
NR1H2-208ENST00000597157 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.94■■■□□ 2.06
NR1H2-208ENST00000597157 GRIN2BQ13224 1484 aa27.93■■■□□ 2.06
NR1H2-208ENST00000597157 KIF27Q86VH2 1401 aa27.9■■■□□ 2.06
NR1H2-208ENST00000597157 PBRM1Q86U86 1689 aa27.87■■■□□ 2.05
NR1H2-208ENST00000597157 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.85■■■□□ 2.05
NR1H2-208ENST00000597157 FBLN2P98095 1184 aa27.82■■■□□ 2.04
NR1H2-208ENST00000597157 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
NR1H2-208ENST00000597157 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.78■■■□□ 2.04
NR1H2-208ENST00000597157 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
NR1H2-208ENST00000597157 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.72■■■□□ 2.03
NR1H2-208ENST00000597157 IGF1RP08069 1367 aa27.7■■■□□ 2.02
NR1H2-208ENST00000597157 SYNJ2O15056 1496 aa27.7■■■□□ 2.02
NR1H2-208ENST00000597157 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.67■■■□□ 2.02
NR1H2-208ENST00000597157 ADAMTS12P58397 1594 aa27.67■■■□□ 2.02
NR1H2-208ENST00000597157 CHD1O14646 1710 aa27.67■■■□□ 2.02
NR1H2-208ENST00000597157 OSCARQ8IYS5 282 aa27.66■■■□□ 2.02
NR1H2-208ENST00000597157 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
NR1H2-208ENST00000597157 CUL7Q14999 1698 aa27.62■■■□□ 2.01
NR1H2-208ENST00000597157 EEA1Q15075 1411 aa27.6■■■□□ 2.01
NR1H2-208ENST00000597157 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.58■■■□□ 2.01
NR1H2-208ENST00000597157 GRIN2AQ12879 1464 aa27.56■■■□□ 2
NR1H2-208ENST00000597157 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.55■■■□□ 2
NR1H2-208ENST00000597157 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.45■■□□□ 1.99
NR1H2-208ENST00000597157 PRXQ9BXM0 1461 aa27.38■■□□□ 1.97
NR1H2-208ENST00000597157 NUP160Q12769 1436 aa27.38■■□□□ 1.97
NR1H2-208ENST00000597157 CEP170Q5SW79 1584 aa27.38■■□□□ 1.97
NR1H2-208ENST00000597157 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.33■■□□□ 1.97
NR1H2-208ENST00000597157 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.28■■□□□ 1.96
NR1H2-208ENST00000597157 KIF21BO75037 1637 aa27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms