Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRBP23467 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRBP23467 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRBP23467 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRBP23467 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRBP23467 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRBP23467 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRBP23467 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRBP23467 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRBP23467 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRBP23467 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRBP23467 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRBP23467 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRBP23467 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRBP23467 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRBP23467 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRBP23467 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRBP23467 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRBP23467 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRBP23467 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRBP23467 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRBP23467 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRBP23467 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRBP23467 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRBP23467 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRBP23467 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRBP23467 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRBP23467 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRBP23467 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRBP23467 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRBP23467 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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