Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NF1P21359 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NF1P21359 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NF1P21359 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NF1P21359 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NF1P21359 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NF1P21359 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NF1P21359 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NF1P21359 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF1P21359 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF1P21359 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF1P21359 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF1P21359 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF1P21359 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF1P21359 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF1P21359 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF1P21359 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF1P21359 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF1P21359 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NF1P21359 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF1P21359 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NF1P21359 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NF1P21359 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF1P21359 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NF1P21359 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NF1P21359 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF1P21359 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NF1P21359 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NF1P21359 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NF1P21359 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NF1P21359 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NF1P21359 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NF1P21359 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NF1P21359 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NF1P21359 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NF1P21359 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NF1P21359 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NF1P21359 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NF1P21359 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NF1P21359 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NF1P21359 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NF1P21359 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NF1P21359 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NF1P21359 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NF1P21359 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NF1P21359 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NF1P21359 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NF1P21359 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NF1P21359 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NF1P21359 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NF1P21359 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NF1P21359 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NF1P21359 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NF1P21359 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NF1P21359 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NF1P21359 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF1P21359 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF1P21359 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF1P21359 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF1P21359 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF1P21359 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF1P21359 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF1P21359 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF1P21359 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF1P21359 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NF1P21359 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NF1P21359 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NF1P21359 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NF1P21359 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF1P21359 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NF1P21359 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF1P21359 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF1P21359 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF1P21359 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NF1P21359 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NF1P21359 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NF1P21359 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF1P21359 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF1P21359 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NF1P21359 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF1P21359 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF1P21359 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NF1P21359 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF1P21359 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF1P21359 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF1P21359 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF1P21359 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF1P21359 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF1P21359 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF1P21359 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF1P21359 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NF1P21359 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NF1P21359 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF1P21359 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF1P21359 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NF1P21359 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF1P21359 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NF1P21359 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF1P21359 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF1P21359 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms