Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP4AP20648 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP4AP20648 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP4AP20648 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP4AP20648 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP4AP20648 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP4AP20648 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP4AP20648 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP4AP20648 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP4AP20648 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP4AP20648 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATP4AP20648 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP4AP20648 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP4AP20648 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP4AP20648 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms