Protein–RNA interactions for Protein: P16112

ACAN, Aggrecan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACANP16112 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACANP16112 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACANP16112 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACANP16112 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACANP16112 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACANP16112 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACANP16112 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACANP16112 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACANP16112 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACANP16112 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACANP16112 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACANP16112 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACANP16112 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACANP16112 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACANP16112 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACANP16112 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACANP16112 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACANP16112 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACANP16112 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACANP16112 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACANP16112 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACANP16112 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACANP16112 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACANP16112 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACANP16112 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACANP16112 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACANP16112 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACANP16112 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACANP16112 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACANP16112 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACANP16112 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACANP16112 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACANP16112 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACANP16112 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACANP16112 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACANP16112 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACANP16112 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACANP16112 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACANP16112 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACANP16112 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACANP16112 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACANP16112 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACANP16112 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACANP16112 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACANP16112 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACANP16112 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACANP16112 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACANP16112 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACANP16112 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACANP16112 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACANP16112 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACANP16112 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACANP16112 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACANP16112 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACANP16112 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACANP16112 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACANP16112 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACANP16112 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACANP16112 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACANP16112 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACANP16112 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACANP16112 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACANP16112 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACANP16112 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACANP16112 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACANP16112 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACANP16112 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACANP16112 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACANP16112 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACANP16112 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACANP16112 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACANP16112 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACANP16112 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACANP16112 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACANP16112 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACANP16112 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACANP16112 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACANP16112 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACANP16112 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACANP16112 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACANP16112 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACANP16112 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACANP16112 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACANP16112 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACANP16112 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACANP16112 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACANP16112 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACANP16112 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACANP16112 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACANP16112 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACANP16112 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACANP16112 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACANP16112 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACANP16112 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACANP16112 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACANP16112 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACANP16112 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACANP16112 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACANP16112 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACANP16112 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms