Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMBSP08397 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMBSP08397 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMBSP08397 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMBSP08397 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMBSP08397 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMBSP08397 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMBSP08397 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HMBSP08397 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMBSP08397 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMBSP08397 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMBSP08397 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMBSP08397 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMBSP08397 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMBSP08397 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMBSP08397 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMBSP08397 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMBSP08397 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMBSP08397 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMBSP08397 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMBSP08397 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMBSP08397 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMBSP08397 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMBSP08397 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMBSP08397 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMBSP08397 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMBSP08397 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMBSP08397 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMBSP08397 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMBSP08397 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMBSP08397 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMBSP08397 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMBSP08397 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMBSP08397 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMBSP08397 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMBSP08397 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMBSP08397 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMBSP08397 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMBSP08397 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMBSP08397 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMBSP08397 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMBSP08397 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMBSP08397 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HMBSP08397 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMBSP08397 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMBSP08397 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMBSP08397 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMBSP08397 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMBSP08397 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMBSP08397 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMBSP08397 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMBSP08397 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMBSP08397 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMBSP08397 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMBSP08397 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMBSP08397 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMBSP08397 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMBSP08397 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMBSP08397 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMBSP08397 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMBSP08397 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMBSP08397 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMBSP08397 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMBSP08397 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMBSP08397 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HMBSP08397 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMBSP08397 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HMBSP08397 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HMBSP08397 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HMBSP08397 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HMBSP08397 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMBSP08397 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HMBSP08397 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMBSP08397 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMBSP08397 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HMBSP08397 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HMBSP08397 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HMBSP08397 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HMBSP08397 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMBSP08397 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMBSP08397 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMBSP08397 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMBSP08397 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMBSP08397 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMBSP08397 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMBSP08397 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMBSP08397 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMBSP08397 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMBSP08397 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMBSP08397 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMBSP08397 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMBSP08397 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMBSP08397 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMBSP08397 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMBSP08397 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMBSP08397 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMBSP08397 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HMBSP08397 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMBSP08397 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMBSP08397 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms