Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYPP08247 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYPP08247 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYPP08247 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYPP08247 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYPP08247 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYPP08247 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SYPP08247 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYPP08247 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYPP08247 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYPP08247 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYPP08247 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYPP08247 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYPP08247 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYPP08247 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYPP08247 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYPP08247 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYPP08247 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYPP08247 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYPP08247 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYPP08247 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYPP08247 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYPP08247 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYPP08247 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYPP08247 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYPP08247 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYPP08247 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYPP08247 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYPP08247 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYPP08247 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYPP08247 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYPP08247 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYPP08247 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYPP08247 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYPP08247 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYPP08247 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYPP08247 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYPP08247 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYPP08247 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYPP08247 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYPP08247 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYPP08247 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYPP08247 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYPP08247 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYPP08247 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYPP08247 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYPP08247 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYPP08247 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYPP08247 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYPP08247 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYPP08247 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYPP08247 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYPP08247 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYPP08247 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYPP08247 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYPP08247 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYPP08247 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYPP08247 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYPP08247 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYPP08247 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYPP08247 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYPP08247 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYPP08247 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYPP08247 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYPP08247 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYPP08247 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYPP08247 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYPP08247 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYPP08247 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYPP08247 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYPP08247 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYPP08247 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYPP08247 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYPP08247 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYPP08247 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYPP08247 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYPP08247 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYPP08247 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYPP08247 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYPP08247 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYPP08247 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYPP08247 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYPP08247 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYPP08247 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYPP08247 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYPP08247 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYPP08247 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYPP08247 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYPP08247 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYPP08247 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYPP08247 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYPP08247 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYPP08247 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYPP08247 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYPP08247 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYPP08247 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYPP08247 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYPP08247 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYPP08247 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYPP08247 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms