Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB2P05107 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB2P05107 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB2P05107 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB2P05107 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB2P05107 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB2P05107 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB2P05107 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB2P05107 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB2P05107 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB2P05107 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB2P05107 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB2P05107 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB2P05107 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB2P05107 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms