Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
SEC24BO95487 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SEC24BO95487 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SEC24BO95487 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SEC24BO95487 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SEC24BO95487 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SEC24BO95487 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SEC24BO95487 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SEC24BO95487 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SEC24BO95487 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SEC24BO95487 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SEC24BO95487 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SEC24BO95487 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SEC24BO95487 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SEC24BO95487 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SEC24BO95487 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SEC24BO95487 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SEC24BO95487 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SEC24BO95487 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SEC24BO95487 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SEC24BO95487 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SEC24BO95487 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SEC24BO95487 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SEC24BO95487 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SEC24BO95487 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SEC24BO95487 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SEC24BO95487 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SEC24BO95487 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SEC24BO95487 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SEC24BO95487 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SEC24BO95487 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SEC24BO95487 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SEC24BO95487 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SEC24BO95487 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SEC24BO95487 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms