Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGR4O95473 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNGR4O95473 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGR4O95473 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGR4O95473 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNGR4O95473 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms