Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SLIT2O94813 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SLIT2O94813 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SLIT2O94813 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SLIT2O94813 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SLIT2O94813 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SLIT2O94813 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SLIT2O94813 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SLIT2O94813 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SLIT2O94813 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SLIT2O94813 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SLIT2O94813 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SLIT2O94813 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SLIT2O94813 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SLIT2O94813 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SLIT2O94813 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SLIT2O94813 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SLIT2O94813 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SLIT2O94813 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SLIT2O94813 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SLIT2O94813 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SLIT2O94813 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SLIT2O94813 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SLIT2O94813 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SLIT2O94813 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SLIT2O94813 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SLIT2O94813 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SLIT2O94813 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SLIT2O94813 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SLIT2O94813 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SLIT2O94813 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SLIT2O94813 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SLIT2O94813 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SLIT2O94813 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SLIT2O94813 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SLIT2O94813 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SLIT2O94813 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SLIT2O94813 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLIT2O94813 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLIT2O94813 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLIT2O94813 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SLIT2O94813 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SLIT2O94813 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SLIT2O94813 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SLIT2O94813 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SLIT2O94813 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SLIT2O94813 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SLIT2O94813 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SLIT2O94813 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SLIT2O94813 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SLIT2O94813 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms