Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RASSF9O75901 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASSF9O75901 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASSF9O75901 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASSF9O75901 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASSF9O75901 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASSF9O75901 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASSF9O75901 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASSF9O75901 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASSF9O75901 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASSF9O75901 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RASSF9O75901 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RASSF9O75901 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RASSF9O75901 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RASSF9O75901 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RASSF9O75901 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RASSF9O75901 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RASSF9O75901 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASSF9O75901 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RASSF9O75901 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RASSF9O75901 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RASSF9O75901 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RASSF9O75901 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASSF9O75901 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms