Protein–RNA interactions for Protein: O60684

KPNA6, Importin subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA6O60684 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KPNA6O60684 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KPNA6O60684 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KPNA6O60684 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KPNA6O60684 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KPNA6O60684 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KPNA6O60684 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KPNA6O60684 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KPNA6O60684 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KPNA6O60684 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KPNA6O60684 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
KPNA6O60684 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KPNA6O60684 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KPNA6O60684 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KPNA6O60684 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KPNA6O60684 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KPNA6O60684 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KPNA6O60684 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
KPNA6O60684 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KPNA6O60684 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KPNA6O60684 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KPNA6O60684 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KPNA6O60684 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KPNA6O60684 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KPNA6O60684 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KPNA6O60684 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KPNA6O60684 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KPNA6O60684 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KPNA6O60684 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KPNA6O60684 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KPNA6O60684 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KPNA6O60684 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms