Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GFRA3O60609 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GFRA3O60609 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GFRA3O60609 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GFRA3O60609 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GFRA3O60609 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GFRA3O60609 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GFRA3O60609 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GFRA3O60609 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GFRA3O60609 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA3O60609 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA3O60609 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GFRA3O60609 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GFRA3O60609 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GFRA3O60609 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms