Protein–RNA interactions for Protein: O60508

CDC40, Pre-mRNA-processing factor 17, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC40O60508 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 30.4
CDC40O60508 HTT-213ENST00000513806 432 ntTSL 510.34□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 30.2
CDC40O60508 HTT-208ENST00000510626 14438 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 30.2
CDC40O60508 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 30.2
CDC40O60508 HTT-209ENST00000512068 401 ntTSL 37.38□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 30.2
CDC40O60508 TOM1-216ENST00000492723 2568 ntTSL 215.21■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 30.2
CDC40O60508 LINC02166-201ENST00000567544 721 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.829e-7■■■■■ 30.1
CDC40O60508 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 30
CDC40O60508 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 313.17□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-206ENST00000553444 724 ntTSL 210.97□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 29.7□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-212ENST00000554539 748 ntTSL 58.06□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-229ENST00000557157 698 ntTSL 54.17□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.861e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 ENO2-210ENST00000539713 543 ntTSL 414.96□□□□□ -0.014e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-207ENST00000537688 547 ntTSL 514.69□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.244e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-212ENST00000542509 825 ntTSL 512.88□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-206ENST00000536199 823 ntTSL 512.28□□□□□ -0.444e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-208ENST00000537838 541 ntTSL 412.19□□□□□ -0.464e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.524e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 RUNX1-214ENST00000475045 1582 ntTSL 510.71□□□□□ -0.694e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 219.87■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 29.5
CDC40O60508 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 29.5
CDC40O60508 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 29.5
CDC40O60508 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.456e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AEN-204ENST00000558327 883 ntTSL 223.33■■□□□ 1.336e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 KLHL42-202ENST00000539176 1894 ntTSL 323.05■■□□□ 1.286e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AEN-205ENST00000559528 895 ntTSL 222.08■■□□□ 1.136e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AEN-206ENST00000560174 461 ntTSL 321.82■■□□□ 1.086e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.086e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.956e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ZBTB7B-206ENST00000487542 873 ntTSL 220.7■□□□□ 0.96e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-221ENST00000523108 1080 ntTSL 520.5■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-212ENST00000520134 592 ntTSL 320.5■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-211ENST00000520019 831 ntTSL 320.5■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.856e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.856e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.856e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-221ENST00000567999 578 ntTSL 1 (best)19.97■□□□□ 0.796e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.776e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-208ENST00000519616 522 ntTSL 519.84■□□□□ 0.776e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ASS1-205ENST00000422569 807 ntTSL 519.72■□□□□ 0.756e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.736e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.726e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)19.44■□□□□ 0.76e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.666e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.586e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-227ENST00000576470 593 ntTSL 218.59■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.546e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.496e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ZBTB7B-204ENST00000461530 658 ntTSL 418.11■□□□□ 0.496e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 417.94■□□□□ 0.466e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.466e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.396e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-203ENST00000518168 1013 ntTSL 217.36■□□□□ 0.376e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.366e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.336e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-217ENST00000521305 1213 ntTSL 517.08■□□□□ 0.326e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.326e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-208ENST00000559417 1035 ntTSL 516.96■□□□□ 0.316e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-224ENST00000569061 651 ntTSL 516.68■□□□□ 0.266e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-204ENST00000561784 612 ntTSL 416.41■□□□□ 0.226e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.26e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 516.19■□□□□ 0.186e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.176e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.126e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.116e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ZBTB7B-205ENST00000483226 243 ntTSL 315.64■□□□□ 0.096e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-222ENST00000523329 543 ntTSL 315.62■□□□□ 0.096e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.076e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.056e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.046e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-217ENST00000566820 549 ntTSL 415.08■□□□□ 06e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 06e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AEN-202ENST00000557787 1242 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -06e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 RAD54L-204ENST00000463715 718 ntTSL 515.03■□□□□ -06e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-208ENST00000572073 782 ntTSL 315.01□□□□□ -0.016e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.056e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.066e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-203ENST00000561741 580 ntTSL 414.63□□□□□ -0.076e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 514.59□□□□□ -0.076e-6■■■■■ 29.1
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