Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ATP10AO60312 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ATP10AO60312 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
ATP10AO60312 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ATP10AO60312 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
ATP10AO60312 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ATP10AO60312 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ATP10AO60312 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ATP10AO60312 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ATP10AO60312 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ATP10AO60312 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ATP10AO60312 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ATP10AO60312 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ATP10AO60312 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ATP10AO60312 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ATP10AO60312 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ATP10AO60312 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ATP10AO60312 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ATP10AO60312 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ATP10AO60312 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ATP10AO60312 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ATP10AO60312 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ATP10AO60312 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ATP10AO60312 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ATP10AO60312 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ATP10AO60312 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ATP10AO60312 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ATP10AO60312 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ATP10AO60312 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ATP10AO60312 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ATP10AO60312 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ATP10AO60312 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ATP10AO60312 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ATP10AO60312 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ATP10AO60312 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ATP10AO60312 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ATP10AO60312 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
ATP10AO60312 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ATP10AO60312 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ATP10AO60312 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ATP10AO60312 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ATP10AO60312 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
ATP10AO60312 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ATP10AO60312 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ATP10AO60312 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ATP10AO60312 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ATP10AO60312 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ATP10AO60312 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
ATP10AO60312 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
ATP10AO60312 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ATP10AO60312 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ATP10AO60312 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ATP10AO60312 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ATP10AO60312 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ATP10AO60312 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ATP10AO60312 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ATP10AO60312 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ATP10AO60312 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
ATP10AO60312 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
ATP10AO60312 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ATP10AO60312 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ATP10AO60312 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ATP10AO60312 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ATP10AO60312 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ATP10AO60312 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ATP10AO60312 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ATP10AO60312 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ATP10AO60312 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ATP10AO60312 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ATP10AO60312 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
ATP10AO60312 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms