Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
KIF3BO15066 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
KIF3BO15066 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
KIF3BO15066 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
KIF3BO15066 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.21■■■■■ 4.03
KIF3BO15066 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
KIF3BO15066 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
KIF3BO15066 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
KIF3BO15066 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
KIF3BO15066 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
KIF3BO15066 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
KIF3BO15066 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
KIF3BO15066 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
KIF3BO15066 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
KIF3BO15066 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
KIF3BO15066 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
KIF3BO15066 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.09■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
KIF3BO15066 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
KIF3BO15066 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
KIF3BO15066 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
KIF3BO15066 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
KIF3BO15066 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
KIF3BO15066 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
KIF3BO15066 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
KIF3BO15066 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
KIF3BO15066 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
KIF3BO15066 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
KIF3BO15066 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
KIF3BO15066 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
KIF3BO15066 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
KIF3BO15066 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
KIF3BO15066 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
KIF3BO15066 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
KIF3BO15066 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
KIF3BO15066 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
KIF3BO15066 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
KIF3BO15066 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
KIF3BO15066 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
KIF3BO15066 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
KIF3BO15066 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
KIF3BO15066 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
KIF3BO15066 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KIF3BO15066 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
KIF3BO15066 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KIF3BO15066 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
KIF3BO15066 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
KIF3BO15066 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
KIF3BO15066 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
KIF3BO15066 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
KIF3BO15066 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
KIF3BO15066 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
KIF3BO15066 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
KIF3BO15066 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
KIF3BO15066 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
KIF3BO15066 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
KIF3BO15066 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
KIF3BO15066 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
KIF3BO15066 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
KIF3BO15066 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
KIF3BO15066 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
KIF3BO15066 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.77■■■■□ 3.96
KIF3BO15066 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
KIF3BO15066 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
KIF3BO15066 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
KIF3BO15066 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
KIF3BO15066 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
KIF3BO15066 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
KIF3BO15066 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
KIF3BO15066 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
KIF3BO15066 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
KIF3BO15066 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
KIF3BO15066 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
KIF3BO15066 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms