Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CITO14578 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CITO14578 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CITO14578 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CITO14578 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CITO14578 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CITO14578 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CITO14578 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CITO14578 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CITO14578 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CITO14578 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CITO14578 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CITO14578 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CITO14578 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CITO14578 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CITO14578 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CITO14578 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CITO14578 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CITO14578 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CITO14578 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CITO14578 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CITO14578 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CITO14578 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CITO14578 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CITO14578 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CITO14578 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CITO14578 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CITO14578 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CITO14578 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CITO14578 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CITO14578 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CITO14578 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CITO14578 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CITO14578 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CITO14578 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CITO14578 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CITO14578 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CITO14578 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CITO14578 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CITO14578 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CITO14578 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CITO14578 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CITO14578 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CITO14578 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CITO14578 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CITO14578 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CITO14578 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CITO14578 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CITO14578 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CITO14578 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CITO14578 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CITO14578 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CITO14578 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CITO14578 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CITO14578 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CITO14578 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CITO14578 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CITO14578 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CITO14578 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CITO14578 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CITO14578 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CITO14578 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CITO14578 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CITO14578 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CITO14578 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CITO14578 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CITO14578 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CITO14578 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CITO14578 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CITO14578 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CITO14578 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CITO14578 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CITO14578 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CITO14578 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CITO14578 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CITO14578 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CITO14578 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CITO14578 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CITO14578 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CITO14578 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CITO14578 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CITO14578 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CITO14578 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CITO14578 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CITO14578 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CITO14578 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CITO14578 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CITO14578 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CITO14578 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CITO14578 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CITO14578 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CITO14578 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CITO14578 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CITO14578 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CITO14578 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CITO14578 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CITO14578 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CITO14578 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CITO14578 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CITO14578 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms