Protein–RNA interactions for Protein: O14513

NCKAP5, Nck-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP5O14513 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP5O14513 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCKAP5O14513 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP5O14513 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP5O14513 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKAP5O14513 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms