Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFRSF10AO00220 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFRSF10AO00220 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFRSF10AO00220 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF10AO00220 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF10AO00220 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFRSF10AO00220 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFRSF10AO00220 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFRSF10AO00220 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFRSF10AO00220 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFRSF10AO00220 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFRSF10AO00220 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFRSF10AO00220 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFRSF10AO00220 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFRSF10AO00220 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNFRSF10AO00220 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF10AO00220 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF10AO00220 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFRSF10AO00220 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF10AO00220 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF10AO00220 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF10AO00220 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF10AO00220 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF10AO00220 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF10AO00220 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF10AO00220 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF10AO00220 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms