Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C4orf47A7E2U8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C4orf47A7E2U8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4orf47A7E2U8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C4orf47A7E2U8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C4orf47A7E2U8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C4orf47A7E2U8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C4orf47A7E2U8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C4orf47A7E2U8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C4orf47A7E2U8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C4orf47A7E2U8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C4orf47A7E2U8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf47A7E2U8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C4orf47A7E2U8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf47A7E2U8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4orf47A7E2U8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms