Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
WDR88Q6ZMY6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
WDR88Q6ZMY6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms