Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms