Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 ISA1YLL027W 753 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 IDP2YLR174W 1239 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 UBX4YMR067C 1251 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 MSN1YOL116W 1149 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 GRE2YOL151W 1029 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 SEC66YBR171W 621 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 GDT1YBR187W 843 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 SSL1YLR005W 1386 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 BEM4YPL161C 1902 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 SLK19YOR195W 2466 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YPL260WYPL260W 1656 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt4.47□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 HTA1YDR225W 399 nt4.47□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 NCB2YDR397C 441 nt4.47□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 MIG3YER028C 1185 nt4.47□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 FAR7YFR008W 666 nt4.47□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 RPF1YHR088W 888 nt4.47□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YJR111CYJR111C 852 nt4.47□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 FSH3YOR280C 801 nt4.47□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 ERB1YMR049C 2424 nt4.47□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 REB1YBR049C 2433 nt4.47□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 VHR1YIL056W 1923 nt4.46□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 VAC7YNL054W 3498 nt4.46□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 TDA2YER071C 381 nt4.46□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 BRR6YGL247W 594 nt4.46□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.46□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 VMA10YHR039C-A 345 nt4.46□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 SDL1YIL167W 633 nt4.46□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YNL324WYNL324W 396 nt4.46□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 SRL1YOR247W 633 nt4.46□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 SPT16YGL207W 3108 nt4.46□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 BIK1YCL029C 1323 nt4.46□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 TCB3YML072C 4638 nt4.45□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 PPQ1YPL179W 1650 nt4.45□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 SRP72YPL210C 1923 nt4.45□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 FMN1YDR236C 657 nt4.45□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YGL152CYGL152C 678 nt4.45□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YGR042WYGR042W 816 nt4.45□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YIL141WYIL141W 390 nt4.45□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YPT7YML001W 627 nt4.45□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 RPC40YPR110C 1008 nt4.45□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 AVT7YIL088C 1473 nt4.44□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YDR133CYDR133C 336 nt4.44□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YER034WYER034W 558 nt4.44□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YER175W-AYER175W-A 165 nt4.44□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YGR045CYGR045C 363 nt4.44□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 POG1YIL122W 1056 nt4.44□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YNL089CYNL089C 477 nt4.44□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YPL077CYPL077C 723 nt4.44□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YPK9YOR291W 4419 nt4.44□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt4.43□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt4.43□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 ASG7YJL170C 630 nt4.43□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YNL150WYNL150W 408 nt4.43□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YPL107WYPL107W 747 nt4.43□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 RSA1YPL193W 1146 nt4.43□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 AFT2YPL202C 1251 nt4.43□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 snR35snR35 204 nt4.43□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 RPN3YER021W 1572 nt4.43□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt4.43□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 SNF2YOR290C 5112 nt4.43□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 TDA1YMR291W 1761 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 COP1YDL145C 3606 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 NSA1YGL111W 1392 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 AVT5YBL089W 1380 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YDR262WYDR262W 819 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 IES6YEL044W 501 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 SPT2YER161C 1002 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 DPH1YIL103W 1278 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YJL119CYJL119C 324 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 FYV7YLR068W 456 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 ASI2YNL159C 870 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 ATX2YOR079C 942 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 ROD1YOR018W 2514 nt4.42□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 TAF6YGL112C 1551 nt4.41□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 ERG11YHR007C 1593 nt4.41□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 IMD4YML056C 1575 nt4.41□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YDR089WYDR089W 2610 nt4.41□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 ARF1YDL192W 546 nt4.41□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 CHZ1YER030W 462 nt4.41□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 PHO80YOL001W 882 nt4.41□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YOL114CYOL114C 609 nt4.41□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 TIF4631YGR162W 2859 nt4.41□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 TAF7YMR227C 1773 nt4.4□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 ARG5,6YER069W 2592 nt4.4□□□□□ -1.7
SSF2Q12153 YHR212CYHR212C 336 nt4.4□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 AGE2YIL044C 897 nt4.4□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 YAR060CYAR060C 336 nt4.4□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 BER1YLR412W 825 nt4.4□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 SWS2YNL081C 432 nt4.4□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 YNL184CYNL184C 327 nt4.4□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 BUD21YOR078W 645 nt4.4□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 YOR169CYOR169C 465 nt4.4□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 TGL3YMR313C 1929 nt4.4□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 POL4YCR014C 1749 nt4.4□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt4.39□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 YBR259WYBR259W 2067 nt4.39□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 NOG1YPL093W 1944 nt4.39□□□□□ -1.71
SSF2Q12153 SRD1YCR018C 666 nt4.39□□□□□ -1.71
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