Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGAEP38570 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms