Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms