Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL24A1Q17RW2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
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COL24A1Q17RW2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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