Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC5P28715 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms